细胞的信号转导过程分为两大类，一类是如蛋白磷分化、脱离分化这么一个可逆的过程。另一类是通过蛋白酶介导的不可逆过程实现信号的传递。而在原和生物中同样发展了精细高效的蛋白水解途径去降解聚集的错误折叠的或损伤的蛋白，以次对外界环境作出快速灵敏的应答，因而对细菌是非常重要。然而无论在每个领域在信号转导过程中蛋白酶的天然抵物是什么，一直是这个领域所面临的一个重大的一个科学问题，也是目前难以解决和研究的问题。